Anatomia Patològica

Servei Assistencial

Presentació

El Servei d’Anatomia Patològica és un servei central de l'Hospital que té la voluntat de donar una atenció assistencial d’excel·lència a la població desenvolupant també la docència i la recerca en l’àmbit de la salut.

Al Servei d’Anatomia Patològica s’examinen les mostres tissulars i fluids orgànics amb l’objectiu de diagnosticar les malalties dels pacients i poder assistir a la presa de decisions terapèutiques dels facultatius de les diverses especialitats assistencials.

Els metges patòlegs són metges especialistes que treballen en equip amb el personal tècnic i tenen com a missió principal elaborar el diagnòstic anatomopatològic final de los mostres rebudes.

Al Servei d’Anatomia Patològica també es practiquen autòpsies clíniques que no solament determinen la causa de la mort dels pacients, sinó també donen més informació sobre les patologies intercurrents i els efectes dels tractaments utilitzats durant la progressió de la malaltia.

Tot i que la nostra missió com a especialitat mèdica continua sent la mateixa des de els seus inicis, el nostre camp d’acció ha experimentat en els últims anys canvis importants deguts a l’avenç tecnològic de la Biologia Molecular.

Els patòlegs no solament estableixen diagnòstics mitjançant l’estudi macroscòpic i microscòpic de les mostres citològiques i tissulars, sinó que també generen informació que és necessària per a la presa de decisions en el camp de l’oncologia. Estudien i interpreten aquesta informació en forma de marcadors biològics pronòstics i dianes terapèutiques moleculars que són útils de cara a establir un pronòstic i tractament personalitzat.

Cartera de serveis

Servei d'Anatomia Patologica El Servei d'Anatomia Patològica de l'Hospital Trueta ofereix una àmplia cartera de serveis que avarca des de les tècniques més senzilles fins a les més complexes que requereixen d'una alta especialització.

El Servei facilitarà l’enviament a altres Centres de referència d’aquelles proves que no realitzi per no disposar de la tecnologia especifica.

A diferència dels hospitals comarcals de la demarcació de Girona, el Servei d'Anatomia Patològica del Trueta ofereix una major complexitat en el maneig macroscòpic, microscòpic i diagnòstic de biòpsies i peces quirúrgiques derivades de la cirurgia d'alta complexitat i de referència del propi Hospital, sobretot de la cirurgia oncològica:

Recte
Gastroesofágica
Hepatobiliar i pancreàtica
Maxil·lofacial
Neurocirurgia
Cirurgia toràcica
Cirurgia otorinolaringològica
Cirurgia d'òrgans endocrins
Cirurgia de rescat post tractament neoadjuvant
Cirurgia de cistoprostatectomia radical
Cirurgia oncològica ginecològica

Forma part de la Unitat de Diagnòstic Molecular i Medicina Personalitzada (UDMMP) de l’Hospital Universitari de Girona Dr. Josep Trueta i ofereix estudis de gens relacionats amb el càncer per seqüenciació Sanger i per seqüenciació massiva d’última generació (NGS), tant en mostres tumorals en blocs de parafina com en plasma.

A més, és el centre de referència de la Regió Sanitària Girona per a la determinació del virus del papil·loma humà (VPH) i disposa d'un banc de mostres tumorals de diferents localitzacions en un congelador de -80º dins el Banc de Tumors, node del Biobanc IDIBGI i integrat a la Xarxa de Bancs de Tumors de Catalunya.

Des de l'any 2016 i en el marc de l'aliança estratègica entre l'ICS Girona i l'IAS, tota l'activitat d'anatomia patològica que generen l'Hospital Santa Caterina i l'Hospital Trueta es concentra a les instal·lacions del Trueta. L'ampliació del Servei ha permès aglutinar totes les autòpsies clíniques i assumir la pràctica totalitat dels estudis de càncer de mama que es realitzen a la Regió Sanitària Girona.

El Servei d'Anatomia Patològica de l'Hospital Trueta també dóna servei a l'Hospital de Campdevànol - Hospital Comarcal del Ripollès- i a la Clínica Salus Informorum de Banyoles.

En la seva cartera de serveis únics dins de la Regió cal destacar:

2 escàners de portaobjectes per a la digitalització de preparacions histològiques Panoramic 1000 DW FLAS IV BF.
1 escàner de portaobjectes per a la didigitalització de preparacions histològiques de fluorescència SCAN II 150 BF/FL.
Anticossos inusuals per a l’estudi immunohistoquímic esdevenint centre de referència d’hematopatologia de l’Hospital de Palamós.
Biòpsies miocàrdiques.
Biòpsies pulmonars de malalties intersticials.
Estudis intraoperatoris derivats de l’ecobroncoscòpia lineal (EBUS) i ecoendoscòpia digestiva (EUS).
Estudis de microscòpia òptica i d’immunofluorescència per a patologia nefrològica i cutània.
Estudis del gangli sentinella dels melanomes.
Estudis del gangli sentinella de tumors ginecològics.
Estudis del ganglis sentinelles per tècnica molecular OSNA (One-Step Nucleic Acid Amplification).
Estudis dels gens HER2; Myc; BCL2 i BCL6 per Hibridació In Situ Fluorescent (FISH).
Estudis de biomarcadors predictius de resposta terapèutica oncològica:
- Immunohistoquimica per ALK i PDL1 en el càncer de pulmó.
- Estudi mutacional de KRAS, NRAS i BRAF per al carcinoma colorectal amb la plataforma molecular Idylla.
- Estudi mutacional d’EGFR en teixit tumoral amb PCR a temps real mitjançant la plataforma COBAS.
- Estudi en plasma de l’ADN tumoral circulant del gen EGFR (“biòpsia líquida”)

Estudis de clonalitat de malaltia limfoide amb reordenaments TCRβ, TCRγ, IgH i IgHκ-λ
Estudis moleculars de gens relacionats amb el càncer per seqüenciació massiva d’última generació (NGS), tant en mostres tumorals en blocs de parafina com en plasma.
- AKT1, AKT3, ALK, APC, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, FGFR1, FGFR2, FGFR3, NF1, HRAS, JAK1, JAK2, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MYC, NRAS, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, POLD1, POLE, PTEN, RB1, RET, ROS1, SLC34A2, SOX2, STK11, TERT, TP53. Addicionalment es cobreixen regions intròniques involucrades en fusions dels següents gens: ALK, BRAF, EGFR, FGFR1, FGFR2, FGFR3, RET i ROS1.
Estudis de mutacions dels gens POLE i RET per metodologia de seqüenciació Sanger.
Detecció d’ADN del Virus del Papil·loma Humà (VPH) d’alt risc en mostres tissulars parafinades mitjançant tecnologia Cobas® HPV.

Al Servei d’Anatomia Patològica de l’Hospital Universitari de Girona Dr. Josep Trueta es processen i diagnostiquen les següents mostres biològiques i s’apliquen en cada cas les tincions o tècniques adients segons els protocols establerts pel mateix Servei.

Les condicions de recollida i transport de les mostres estan recollides al document P-APA-006 “Protocol d’Identificació, fixació, envasat i trasllat de mostres de diagnòstic d’Anatomia Patològica”.

BIÒPSIES

Peces quirúrgiques i biòpsies intraoperatòries. Punchs de pell i falques cutànies, biòpsies d’ungles per a determinar la presència de fongs, biòpsies de lesions de mucosa orofaríngia i glàndules salivals menors per a estudi de la S. de Sjögren, biòpsies de quists i tumors de maxil·lars, biòpsies de foses nasals i si paranasals, biòpsies d’artèries temporals i plaques d’ateroma d’artèries carotídies, estudi de tromboèmbols arterials, biòpsies de còrnia i conjuntivals, biòpsies estereotàxiques de tumors cerebrals i lesions desmielinitzants del sistema nerviós central, biòpsies endoscòpiques del tracte digestiu i respiratori, biòpsies pleurals, biòpsies de pulmó per videotoracoscòpia de pneumopaties intersticials, nòduls pulmonars i emfisema bullós, biòpsies de ganglis mediastínics per mediastinoscòpia, biòpsies amb agulla gruixuda (BAG), cilindres i tru-cuts de lesions tumorals o pseudotumorals, biòpsies renals, biòpsies de múscul i nervi perifèric, biòpsies ganglionars i de moll d’òs, biòpsies hepàtiques, biòpsies de lesions tumorals o pseudotumorals del sistema esquelètic, biòpsies de bufeta urinària, biòpsies de pròstata per a screening de PSA, reseccions transuretrals de pròstata, biòpsies testiculars per a estudi d’infertilitat, legrats endometrials, biòpsies de pòlips endometrials per histeroscòpia, biòpsies de trompes uterines per lligadura de trompes, biòpsies de conductes deferents per esterilització masculina, biòpsies de cèrvix per a estudi de lesions associades a l’HPV.

El temps de resposta mesurat entre la recepció de la biòpsia i la validació de l’informe per part del patòleg varia segons la complexitat de la mostra que estableix l’aplicatiu ETPAT d’Anatomia Patològica: Biòpsies bàsiques i intermèdies <=10 dies; Complexes i d’Alta complexitat <=15 dies. Per disminuir els temps de demora el sistema de traçabilitat del Servei pot identificar les mostres preferents o urgents.

CITOLOGIES

Esputs, moc nasal, broncoaspirats (BAS), rentats bronquioloalveolars (BAL), citologies exfoliatives de líquids pleurals i ascítics peritoneals, rentats de sac de Douglas, citologies per raspallat de vies biliars i bronquis, citologies ginecològiques de cèrvix uterí i endometri, citologia de líquid cefaloraquidi i puncions aspiracions amb agulla fina (PAAF) de lesions nodulars, tumorals i pseudotumorals.

Estudis intraoperatoris derivats de l’ecobroncoscòpia lineal (EBUS) i ecoendoscòpia digestiva (EUS).

El temps de resposta mesurat entre la recepció de la mostra i la validació de l’informe per part del patòleg varia segons el tipus de citologia: Citologies ginecològiques <=20 dies; Citologies generals no ginecològiques i PAAFs <=10 dies. Per disminuir els temps de demora el sistema de traçabilitat del Servei pot identificar les citologies preferents o urgents.

AUTÒPSIES

Autòpsies clíniques, no judicials. Autòpsies clíniques d’adults, pediàtriques, perinatals i fetals, incloent les autòpsies fetals per interrupció legal de l’embaràs degudes a malformacions congènites, cromosomopaties, metabolopaties o risc matern.

El temps de resposta mesurat entre la recepció de la petició d’autòpsia i la validació de l’informe final definitiu per part del patòleg varia segons el tipus d’autòpsia: Autòpsia de fetus/nounats <=90 dies; Autòpsies d’adult:<=150 dies. Per disminuir els temps de demora el sistema de traçabilitat del Servei pot identificar les autòpsies que siguin preferents i que requereixin un informe més urgent.

En tot cas i, per mitigar aquesta demora, s’efectuarà un informe provisional amb les troballes macroscòpiques de l’autòpsia en un màxim de tres dies entre la recepció de la petició i la validació de l’informe.

TÈCNIQUES DE RUTINA I ESPECIALS

Hematoxilina-Eosina, Papanicolaou, Periòdic-Àcid-Shiff (PAS), PAS-Alfa-Amilasa, PAS-Blau Alcià, Blau Alcià, Ferro de Perls, Ferro Col·loïdal, Giemsa, Mucicarmín de Mayer, Tricròmic de Masson, Reticulina de Gomori, Plata methenamina de Jones, Elàstiques de Verhoeff, Orceïna, Ziehl-Neelsen, Fite, Gram, Grocott, Roig Congo, Roig Congo amb Permanganat, Warthin-Starry, Osmi.

TÈCNIQUES IMMUNOHISTOQUÍMIQUES (AUTOSTAINER)

Citoqueratina (CK)7,CK19, CK20, CKAE1/AE3, CK34ßE12, CK5/6, CKMNF-116, Desmina, Antigen Epitelial Ber EP4, Antigen Epitelial de Membrana (EMA), Proteïna Glial Fibril·lar Acidòfila (PGFA), Proteïna S-100, Vimentina, Actina de múscul llis (SMA), Miosina de múscul llis (SMM), Antigen carcinoembriogènic (CEA), Antigen relacionat a l’epiteli (MOC-31), Antigen relacionat amb el càncer de Mama (GCDFP15), Antigen Prostàtic específic (PSA), CA125, Antigen Hepatocític específic (Hepar-1), Tiroglobulina, Calcitonina, Col·lagen IV, Cromogranina, Sinaptofisina, Receptors d’estrògens, Receptors de Progesterona, HER-2 (HercepTest ™), p53, Ki-67, E-Cadherina, EGFR, HMB45, Melan-A, c-KIT, Pan-Melanoma, PIN-cocktail, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EBV-LMP1, Mieloperoxidasa, TdT, TTF-1, ALK1, Amiloide A, bcl-2, bcl-6, Calretinina, Ciclina D1, Citomegalovirus, CD1a,CD3,CD4, CD5, CD8,CD10, CD15, CD20,CD21, CD23, CD30, CD31, CD34, CD43, CD45, CD45R0, CD56,CD61, CD68, CD79a, CD99, CD138, p16, Calponina, MUM-1, h-caldesmon, Miogenina, Mamoglobina, Carcinoma de cèl·lules renals (RCC), Inhibina, N-Cadherina, D2-40, Fosfatasa Alcalina Placentària, α-1-Fetoproteïna, Gonadotrofina Coriònica Humana, CDX-2, WT1, Kappa,Lambda,Pax5,ZAP-70,Glicoforina C,ß-Catenina,Her-pes Virus Simplex 1,Napsina A,Factor XIII,HHV8.

TÈCNIQUES IMMUNOFLUORESCÈNCIA DIRECTA

Aquesta metodologia s’utilitza per a la determinació de la presència d’immunocomplexos en les malalties ampul·loses de la pell i Glomerulonefritis, mitjançant anticossos marcats amb fluoresceïna de cadenes pesades d’immunoglobulines (IgA, IgG, IgM), cadenes lleugeres (Kappa, Lambda) i fraccions de complement (C3).

Les biòpsies a estudiar s’han de trametre en fresc, es congelen en isopentà, es tallen en un criòstat i s’examinen amb un microscopi de fluorescència.

TÈCNIQUES DE BIOLOGIA MOLECULAR

- Determinació de l’ADN del virus del Papil·loma Humà (VPH)

En el protocol de les activitats per al cribratge del càncer de coll uterí del Pla Director d’Oncologia del Servei Català de la Salut s’ofereix una prova de determinació del Virus del Papil·loma Humà (VPH) d’alt risc amb les següents indicacions: història de cribratge inadequat, ASC-US (dones amb lesions de diagnòstic incert) i en el seguiment post-conització de lesions intraepitelials.

Actualment al Servei d’Anatomia Patològica i com a centre de referència de l’Àrea Sanitària de Girona, s’utilitza el sistema Cobas 4800 que detecta el VPH d’alt risc.

El temps de resposta mesurat entre la recepció de la mostra i la validació de l’informe ha de ser <=20 dies.

- Estudis de clonalitat limfoide

Reordenaments TCRβ, TCRγ, IgH i IgHκ-λ

-Tècnica d’hibridització in situ amb Fluoresceïna (FISH) en el càncer de mama i patologia limfoide

Estudi dels gens HER2, Myc, BCL2 i BCL6

-Estudi dels ganglis sentinelles pel Sistema OSNA (One Step Nucleic Acid Amplification) (Sysmex®).

Tècnica d’anàlisi molecular del RNAm específic de la citoqueratina 19 de les cèl·lules tumorals del càncer de mama i endometri mitjançant RT-LAMP (reverse transcription-loop mediated isothermal amplification).

L’estudi del gangli sentinella del càncer de mama i endometri es realitza habitualment mitjançant la pràctica intraoperatòria d’impremtes a nivell de la superfície de tall del gangli i estudi citològic per a determinar la presència o absència de cèl·lules tumorals. Si el resultat és positiu el cirurgià procedeix a fer limfadenectomies més extenses. Si és negatiu es realitza un estudi diferit del gangli amb talls seriats i estudi immunohistoquímic per a citoqueratines. En l’estudi diferit es detecten micrometàstasis en un 12-15% dels casos analitzats, en els que suposa una reintervenció.

Amb l’aplicació del Sistema OSNA en l’estudi del gangli sentinella es fa una determinació quantitativa del RNAm de la citoqueratina 19 de tot el gangli mitjançant l’homogeneïtzació del mateix, la qual cosa permet establir diferents resultats (aïllades cèl·lules tumorals, micrometàstasis i macrometàstasis), que comporten actituds terapèutiques diferenciades.

Amb la implementació d’aquesta tècnica un percentatge significatiu de pacients s’estalvien una segona intervenció quirúrgica i una comorbilitat associada.

-Estudi mutacional mitjançant PCR i seqüenciació directe Sanger

Gen POLE: Detecció d’onze mutacions patogèniques en els exons: 9, 11, 13 i 14 (NM_006231; GRCh37).

Gen RET: Detecció de mutacions patogèniques en els exons 14 i 15.

-Anàlisi molecular de tumors amb tecnologia Next Generation Sequencing (NGS).

Panell de disseny propi que permet cobrir la major part de regions codificants en gens d’interès així com les regions implicades en les fusions més importants. També permet analitzar de manera eficient CNAs i determinar amplificacions i delecions en els gens estudiats. En ser un panell propi permet de manera àgil anar afegint regions d’interès noves i optimitzar regions conegudes.

S’ha posat a punt tot un pipeline d’anàlisis focalitzat en l’anàlisi de senyals d’origen somàtic, senyals estructurals i CNAs. El procés intenta ser automàtic i complet fins a generar un informe final. L’informe final conté informació de les variants trobades dividides en tres grups, les variants amb implicació terapèutica directe, les variants amb implicació clínica i les variants rares de baixa freqüència que puguin tenir interès

en la recerca. Addicionalment s’inclou informació de la qualitat de la seqüenciació de les regions d’interès i de les dianes terapèutiques incloses en la anàlisis.

Aquest panel cobreix completament les regions exòniques dels següents gens:AKT1, AKT3, ALK, APC, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, FGFR1, FGFR2, FGFR3, NF1, HRAS, JAK1, JAK2, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MYC, NRAS, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, POLD1, POLE, PTEN, RB1, RET, ROS1, SLC34A2, SOX2, STK11, TERT, TP53. Addicionalment es cobreixen regions intròniques involucrades en fusions dels següents gens: ALK, BRAF, EGFR, FGFR1, FGFR2, FGFR3, RET i ROS1.

El protocol de llibreries utilitzat és el SureSelectXT HS Target Enrichment System (Agilent Technologies). Aquest protocol parteix d’un mínim de 50ng d'ADN de doble cadena i és apte per a mostres amb un alt nivell de degradació com les provinents de FFPE. La fragmentació de l’ADN és de caràcter enzimàtic; seguidament hi ha un procés de reparació dels extrems, adenilació, lligació dels adaptadors específics i amplificació conjuntament amb l’indexing de cada mostra. Després d’un punt de control (TapeStation), els fragments obtinguts són hibridats amb les sondes de RNA biotinilades corresponents a les regions d’interès del panell dissenyat. L’enriquiment de les regions d’interès es realitza a partir de la química de captura d’Agilent Technologies, SureSelect. Seguidament, es realitza la captura a partir de les boles d’estreptavidina i s’amplifica el DNA capturat. Finalment es realitza l’últim punt de control per tal d’obtenir els perfils de llibreria esperats i la molaritat de cada mostra. Les llibreries resultants són multiplexades i seqüenciades en l’instrument MiSeq (Illumina) a partir de la química basada en l’amplificació clonal i la seqüenciació per síntesi.

L’anàlisi es realitza mitjançant el software d’anàlisi bioinformàtica desenvolupat i validat internament. Els extrems dels reads son processats per eliminar bases de baixa qualitat i adaptadors utilitzant l’eina fastp. L’alineament dels reads al genoma de referència (GRCh37/hg19) es realitza amb el programa BWA-MEM i la posterior eliminació de reads duplicats es porta a terme amb l’eina Picard. La detecció de SNVs i INDELs (1-50 pb) es realitza combinant els resultats de les eines Mutect2 i FreeBayes. Les variants estructurals (SV) majors de 50 pb són detectades mitjançant el software Manta. La detecció d’alteracions de número de còpia (CNAs) es realitza mitjançant els programes CNVkit i PureCN. L’anotació de variants a un nivell general es realitza amb el Variant Effect Predictor (VEP) utilitzant la nomenclatura estàndard HGVS en base a les isoformes canòniques dels gens del panell. Per cada variant s’incorpora informació dels predictors de patogenicitat Polyphen2, SIFT, MutationTaster i Provean i les variants d’splicing s’analitzen amb l’SpliceAI i el MaxEntScan. Les freqüències

poblacionals s’anoten amb el gnomAD, l’ExAC i 1000Genomes. L’anotació de variants amb evidència clínica en càncer es realitza amb les últimes versions disponibles del CIViC i el CGI. Les fusions s’anoten amb la base de dades chimerKB. La classificació de variants reportades es realitza a tres nivells, segons evidència clínica i tractament: (i) variants clíniques amb tractament associat (ii) altres variants (comunes i rares) amb evidència d’interacció/resistència al tractament, (iii) variants rares (MAF < 1%) sense evidència clínica. Addicionalment, es crea un registre amb totes les variants identificades per cada mostra i s’actualitza la base de dades interna, possibilitant una futura re-interpretació i/o classificació degut a noves evidències científiques.

La detecció de senyals en cèl·lula somàtica es veu afectat per l’enriquiment de la mostra en aquest tipus de cèl·lula, és per això que es recomana una % de cèl·lula somàtica que sigui superior al 10% i en general quan més enriquida estigui la mostra millor. Les senyals de fusió i en general senyals estructurals i CNAs es veuen encara més afectades per l’enriquiment clonal de la mostra i per tant en mostres poc enriquides no es pot assegurar la seva detecció.

Equip

Personal Mèdic:

Cap de Servei: Eugeni López-Bonet

Cap de Secció: Maria Victoria Huerta Anaya

Ferran Pérez Bueno

Rosa Ortiz Duran

Cristina Meléndez Muñoz

Carmen Vásquez Dongo

Laura Ferrazza Martin

Albert Gaspa Maynou

Xevi Pozo Ariza

Cristofer Nienow Pereira

Macarena Centeno Haro

Ana Aula Olivar

Hristo Iliev Iliev

Begoña Fuertes Negro

Irma Ramos Olive

Biòloga:

Glòria Oliveras Serrat

Personal Tècnic i Administratiu:

Coordinadora: Mª Carmen Pérez Martínez

Llocs de treball de tècnics: 20

Coordinació tècnica: 1

Àrea de recepció i registre de mostres: 2

Àrea macroscòpica i autòpsies: 3

Àrea microtomia i histoquimica: 6

Immunohistoquimica: 3

Àrea biologia molecular: 1

Citotècnics: 4 torn matí

Zelador: 1

Suport administratiu: 2

Docència

Servei d'Anatomia Patologica

La Unitat Docent d’Anatomia Patològica de l’Hospital Universitari Dr. Josep Trueta de Girona està ubicada a les plantes -1 i -2 de l’edifici hospitalari. Disposa de tots els elements necessaris per a l’adquisició dels coneixements mínims imprescindibles per a la formació de nous especialistes. A finals de l’any 2015 i durant el 2016 es varen realitzar les obres d’ampliació i millora de les instal·lacions per tal de donar cabuda a les noves activitats que s’hi realitzen.

La Unitat Docent està acreditada amb un metge resident per any.

El servei consta de:

Zona de recepció de mostres i secretaria.
Àrea de tallat macroscòpic de mostres de biòpsies i peces quirúrgiques.
Àrea tècnica:
- Processament de mostres citològiques.
- Microtomia i tinció de les mostres histològiques i citològiques.
- Histoquimica, immunohistoquímica i immunofluorescència.
- Tècniques de biologia molecular:
  - Hibridació in situ fluorescent (FISH).
  - Determinació del VPH per tècnica Cobas.
  - PCR-real time per a la determinació de biomarcadors.
  - Tècnica OSNA per a l’estudi de ganglis sentinelles.
  - El Servei forma part de la Unitat de Diagnòstic Molecular i Medicina Personalitzada (UDMMP) de l’Hospital Universitari de Girona Dr. Josep Trueta i ofereix estudis de gens relacionats amb el càncer per seqüenciació Sanger i per seqüenciació massiva d’última generació (NGS), tant en mostres tumorals en blocs de parafina com en plasma.

Sala d’autòpsies dotada dels elements de seguretat laboral necessaris per a la realització d’autòpsies d’alt risc.
Àrea mèdica equipada amb ordinadors, pantalles per a la patologia digital i microscopis molts d’ells amb doble capçal.
Sala de residents i de sessions equipada amb pantalles per a la patologia digital i microscopis multicapçals.
Microscopi digital dotat de càmera fotogràfica i projector.
Elements informàtics necessaris per a la patologia digital amb escàner de digitalització de preparacions.
Programa informàtic propi del Centre Corporatiu ICS (ETPAT) que ofereix la traçabilitat completa de les mostres.
Arxiu manual de casos interessants per a la docència.
Llibres actualitzats de patologia quirúrgica general i de les diferents subespecialitats d’Anatomia Patològica amb dotació econòmica assegurada per a la seva actualització periòdica.
Entrada virtual a diverses biblioteques amb accés els seus recursos.
El propi Servei disposa d’uns espais al Parc Hospitalari Martí i Julià dins l’Hospital de Santa Caterina on hi estan ubicats tres llocs de treball per a patòlegs i un per citotècnics, tots ells equipats amb pantalles per a la patologia digital, microscopis i ordinadors connectats amb xarxa amb l’Hospital Trueta. També es disposa dels elements necessaris per a realitzar estudis intraoperatoris tant de biòpsies com de citologies.

El Servei d’Anatomia Patològica s’estructura en tres grans àrees i en cada cas es processen i diagnostiquen les mostres biològiques aplicant les tincions o tècniques adients segons els protocols establerts pel mateix Servei:

Biòpsies: Estudi macroscòpic i microscòpic de biòpsies i peces quirúrgiques. L’Àrea de biòpsies es divideix per sistemes:
- Patologia de Tub Digestiu.
- Patologia Hepato-Bilio-Pancreàtica.
- Patologia de Cap i Coll (ORL i maxil•lofacial).
- Patologia Mamària.
- Patologia Ginecològica.
- Patologia Urològica.
- Patologia Pulmonar.
- Patologia Endocrina.
- Dermatopatologia.
- Hematopatologia.
- Neuropatologia (SNC).
- Nefropatologia.
- Patologia de parts toves i os
Citologies: L’àrea de Citologia està constituïda per citologies ginecològiques, no ginecològiques (exfoliativa, líquids) i PAAF (Punció Aspiració Agulla Fina). Hi ha un màxim responsable de l’àrea de citopatologia.
Autòpsies clíniques: Estudis post mortem d’adults, pediàtrics, perinatals i fetals, incloent les autòpsies fetals per interrupció legal de l’embaràs. Tots els facultatius realitzen les autòpsies en torn rotatiu.

El nombre de facultatius és de quinze més un resident per any i una biòloga molecular

El Servei disposa de 20 Tècnics Superiors en Anatomia Patològica, 2 administratius i 1 zelador

Activitat assistencial dels darrers anys:

	2017	2018	2019	2020	2021	2022
PETICIONS	39262	43901	45941	39786	43371	46354
MOSTRES	47616	53022	55381	47626	52736	58042
AUTOPSIES TOTALS	58	61	65	58	38	55
AUTOPSIES ADULTS	13	17	26	24	10	20
AUTOPSIES FETUS	43	44	37	28	22	27
AUTÒPSIES NEONATS	2	0	2	6	6	8
BIÒPSIES TOTALS	24855	27408	29056	23130	26896	30354
BIÒPSIES SENZILLES	17183	19237	20685	12582	15398	17581
BIÒPSIES COMPLEXES	7672	8171	8371	10548	11498	12773
BIÒPSIES INTRAOPERATÒRIES	768	986	894	Sense dades	Sense dades	Sense dades
CITOLOGIES TOTALS	18458	20340	20356	14947	17600	18760
CITOLOGIES NO GINECOLÒGIQUES	3617	3626	3291	4141	3384	5108
CITOLOGIA GINECOLÒGICA	13690	15506	15879	9390	12516	11594
CITOLOGIES PAAF	1151	1208	1186	1416	1700	2058
TÈCNIQUES TOTALS	150990	163238	182361	163260	197056	147551
TÈCNIQUES NULL	16	6	2369	2698	1163	1229
FISH	48	34	61	93	199	191
HPV	4245	5212	5931	4924	6815	8300
PCR	128	729	596	591	564	729
EXTRACCIONS DNA			274	347	500	586
PLATAFORMES NGS					259	225
OSNA	82	105	52	51	126	134
HISTOQUIMICA	33534	34232	35271	6059	7218	7361
IMMUNOFLUORESCÈNCIA	573	678	910	939	1057	1083
IMMUNOHISTOQUIMICA	18664	20854	23118	25751	28756	26345
HIBRIDACIÓ IN SITU			177	160	212	246
RUTINA	93782	101491	113602	121647	150187	101122

Resum de l'especialitat i cronograma de rotacions:

Recerca

RECERCA I PRODUCCIÓ CIENTÍFICA

El Servei d’Anatomia Patològica participa en múltiples assajos clínics del servei d’oncologia (ICO_Girona) i col·labora en diversos projectes d’investigació d’altres serveis de l’Hospital.

Producció científica dels últims anys:

Vásquez-Dongo C, Rivas A, Ferrer B, Bodet D, Valverde C, Delbene C, Ramón Y Cajal S, Romagosa C. Tumor vulvar similar a lipoblastoma: descripción de un nuevo caso y revisión de la literatura [Lipoblastoma-like tumor of the vulva: A case report and review of the literature]. Rev Esp Patol. 2022 Apr-Jun;55(2):139-144. Spanish. doi: 10.1016/j.patol.2019.10.001. Epub 2020 Jan 2. PMID: 35483770.

Polonio-Alcalá E, Porta R, Ruiz-Martínez S, Vásquez-Dongo C, Relat J, Bosch-Barrera J, Ciurana J, Puig T. AZ12756122, a novel fatty acid synthase inhibitor, decreases resistance features in EGFR-TKI resistant EGFR-mutated NSCLC cell models. Biomed Pharmacother. 2022 Dec;156:113942. doi: 10.1016/j.biopha.2022.113942. Epub 2022 Oct 28. PMID: 36411628.

Temprana-Salvador J, López-García P, Castellví Vives J, de Haro L, Ballesta E, Rojas Abusleme M, Arrufat M, Marques F, Casas JR, Gallego C, Pons L, Mate JL, Fernández PL, López-Bonet E, Bosch R, Martínez S, Ramón Y Cajal S, Matias-Guiu X. DigiPatICS: Digital Pathology Transformation of the Catalan Health Institute Network of 8 Hospitals-Planification, Implementation, and Preliminary Results. Diagnostics (Basel). 2022 Mar 30;12(4):852. doi: 10.3390/diagnostics12040852. PMID: 35453900; PMCID: PMC9025604.

Carbó-Bagué A, Rubió-Casadevall J, Puigdemont M, Sanvisens A, Oliveras G, Coll M, Del Olmo B, Perez-Bueno F, Marcos-Gragera R. Epidemiology and Molecular Profile of Mucosal Melanoma: A Population-Based Study in Southern Europe. Cancers (Basel). 2022 Feb 3;14(3):780. doi: 10.3390/cancers14030780. PMID: 35159047; PMCID: PMC8833680.

Planellas P, Cornejo L, Farrés R, Pigem A, Timoteo A, Ortega N, Pellino G, Rodríguez-Hermosa JI, López-Bonet E, Fernández-Real JM, Codina-Cazador A. Prognostic significance of the microbiome-adipose tissue axis in rectal cancer: protocol of a prospective observational study. BJS Open. 2022 Mar 8;6(2):zrac009. doi: 10.1093/bjsopen/zrac009. PMID: 35257139; PMCID: PMC8902345.

Rubió-Casadevall J, Ciurana E, Puigdemont M, Sanvisens A, Marruecos J, Miró J, Urban A, Palhua RL, Martín-Romero F, Ortiz-Duran MR, Marcos-Gragera R. Population-Based Analysis of Trends in Incidence and Survival of Human Papilloma Virus-Related Oropharyngeal Cancer in a Low-Burden Region of Southern Europe. Int J Environ Res Public Health. 2022 Apr 15;19(8):4802. doi: 10.3390/ijerph19084802. PMID: 35457669; PMCID: PMC9027195.

Rubió-Casadevall J, Carbó-Bagué A, Puigdemont M, Osca-Gelis G, Oliveras G, Vilar-Coromina N, Ferrer-Fabrega B, Urban A, Llobet-Roma M, Martín-Romero F, Perez-Bueno F, Marcos-Gragera R. Population-based analysis of the prevalence of BRAF mutation in patients diagnosed with cutaneous melanoma and its significance as a prognostic factor. Eur J Dermatol. 2021 Oct 1;31(5):616-622. doi: 10.1684/ejd.2021.4136. PMID: 34789445.

Polonio-Alcalá E, Rabionet M, Ruiz-Martínez S, Palomeras S, Porta R, Vásquez-Dongo C, Bosch-Barrera J, Puig T, Ciurana J. Polycaprolactone Electrospun Scaffolds Produce an Enrichment of Lung Cancer Stem Cells in Sensitive and Resistant EGFRm Lung Adenocarcinoma. Cancers (Basel). 2021 Oct 22;13(21):5320. doi: 10.3390/cancers13215320. PMID: 34771484; PMCID: PMC8582538.

Sanvisens A, Puigdemont M, Rubió-Casadevall J, Vidal-Vila A, López-Bonet E, Martín-Romero F, Marcos-Gragera R. Differences in the Impact of COVID-19 on Pathology Laboratories and Cancer Diagnosis in Girona. Int J Environ Res Public Health. 2021 Dec 16;18(24):13269. doi: 10.3390/ijerph182413269. PMID: 34948878; PMCID: PMC8701849.

Bosch-Barrera J, Verdura S, Ruffinelli JC, Carcereny E, Sais E, Cuyàs E, Palmero R, Lopez-Bonet E, Hernández-Martínez A, Oliveras G, Buxó M, Izquierdo A, Morán T, Nadal E, Menendez JA. Silibinin Suppresses Tumor Cell-Intrinsic Resistance to Nintedanib and Enhances Its Clinical Activity in Lung Cancer. Cancers (Basel). 2021 Aug 19;13(16):4168. doi: 10.3390/cancers13164168. PMID: 34439322; PMCID: PMC8394850.

Marco V, Garcia F, Rubio IT, Soler T, Ferrazza L, Roig I, Mendez I, Andreu X, Mínguez CG, Tresserra F. Adenoid cystic carcinoma and basaloid carcinoma of the breast: A clinicopathological study. Rev Esp Patol. 2021 Oct-Dec;54(4):242-249. doi: 10.1016/j.patol.2020.09.005. Epub 2020 Dec 31. PMID: 34544554.

Caravaca-Fontán F, Trujillo H, Alonso M, Díaz-Encarnación M, Cabello V, Ariceta G, Quintana LF, Marco H, Barros X, Ramos N, Rodríguez-Mendiola N, Cruz S, Fernández-Juárez G, Rodríguez E, de la Cerda F, Pérez de José A, López I, Fernández L, Pérez Gómez V, Ávila A, Bravo L, Lumbreras J, Allende N, Sanchez de la Nieta MD, Olea T, Melgosa M, Huerta A, Miquel R, Mon C, Fraga G, de Lorenzo A, Draibe J, González F, Shabaka A, Illescas ML, Calvo C, Oviedo V, Da Silva I, Goicoechea de Jorge E, Caravaca F, Praga M; C3G Study Group of the Spanish Group for the Study of Glomerular Diseases (GLOSEN). Validation of a Histologic Scoring Index for C3 Glomerulopathy. Am J Kidney Dis. 2021 May;77(5):684-695.e1. doi: 10.1053/j.ajkd.2020.11.011. Epub 2020 Dec 22. PMID: 33359150.

Ortega Rodriguez AA, Centeno Haro M, Caro Cardera JL, Joly Torta C, de Manuel-Rimbau Muñoz J. Dural Metastasis from Breast Carcinoma Mimicking Sub-acute Subdural Hematoma: a Case Report. Indian J Surg Oncol. 2021 Apr;12(Suppl 1):197-200. doi: 10.1007/s13193-021-01283-y. Epub 2021 Feb 1. PMID: 33994747; PMCID: PMC8119506.

Ibáñez R, Roura E, Monfil L, Rodríguez LA, Sardà M, Crespo N, Pascual A, Martí C, Fibla M, Gutiérrez C, Lloveras B, Oliveras G, Torrent A, Català I, Bosch FX, Bruni L, de Sanjosé S. Long-term protection of HPV test in women at risk of cervical cancer. PLoS One. 2020 Aug 27;15(8):e0237988. doi: 10.1371/journal.pone.0237988. Erratum in: PLoS One. 2020 Nov 20;15(11):e0243000. PMID: 32853216; PMCID: PMC7451648.

Cuatrecasas M, Gorostiaga I, Riera C, Saperas E, Llort G, Costa I, Matias- Guiu X, Carrato C, Navarro M, Pineda M, Dueñas N, Brunet J, Marco V, Trias I, Busteros JI, Mateu G, Balaguer F, Fernández-Figueras MT, Esteller M, Musulén E.

Complete Loss of EPCAM Immunoexpression Identifies EPCAM Deletion Carriers in MSH2-Negative Colorectal Neoplasia. Cancers (Basel). 2020 Sep 29;12(10):2803. doi: 10.3390/cancers12102803. PMID: 33003511; PMCID: PMC7599495.

Pilco Teran M, Merino Ribas A, Martin Alemany N, Barros Freiria X, Rubio Casadevall J, Pérez Bueno F, García Méndez I, Castillo Devia M, Noboa Paez C, Torguet Escuder P, Calabia Martínez J. Acute tubulointerstitial nephritis

induced by the tyrosine kinase inhibitor vandetanib. Invest New Drugs. 2021 Feb;39(1):237-239. doi: 10.1007/s10637-020-00973-8. Epub 2020 Jul 9. PMID: 32648118.

Ledesma-Durán A, Ortiz-Durán EA, Aragón JL, Santamaría-Holek I. Eckhaus selection: The mechanism of pattern persistence in a reaction-diffusion system. Phys Rev E. 2020 Sep;102(3-1):032214. doi: 10.1103/PhysRevE.102.032214. PMID: 33076036.

Verdura S, Cuyàs E, Cortada E, Brunet J, Lopez-Bonet E, Martin-Castillo B, Bosch-Barrera J, Encinar JA, Menendez JA. Resveratrol targets PD-L1 glycosylation and dimerization to enhance antitumor T-cell immunity. Aging (Albany NY). 2020 Jan 4;12(1):8-34. doi: 10.18632/aging.102646. Epub 2020 Jan 4. PMID: 31901900; PMCID: PMC6977679.

Lopez-Bonet E, Buxó M, Cuyàs E, Pernas S, Dorca J, Álvarez I, Martínez S, Pérez-Garcia JM, Batista-López N, Rodríguez-Sánchez CA, Amillano K, Domínguez S, Luque M, Morilla I, Stradella A, Viñas G, Cortés J, Oliveras G, Meléndez C,

Castillo L, Verdura S, Brunet J, Joven J, Garcia M, Saidani S, Martin-Castillo B, Menendez JA. Neoadjuvant Metformin Added to Systemic Therapy Decreases the Proliferative Capacity of Residual Breast Cancer. J Clin Med. 2019 Dec

11;8(12):2180. doi: 10.3390/jcm8122180. PMID: 31835708; PMCID: PMC6947627.

Dámaso E, Canet-Hermida J, Vargas-Parra G, Velasco À, Marín F, Darder E, Del Valle J, Fernández A, Izquierdo À, Mateu G, Oliveras G, Escribano C, Piñol V, Uchima HI, Soto JL, Hitchins M, Farrés R, Lázaro C, Queralt B, Brunet J, Capellá G, Pineda M. Highly sensitive MLH1 methylation analysis in blood identifies a cancer patient with low-level mosaic MLH1 epimutation. Clin Epigenetics. 2019 Nov 28;11(1):171. doi: 10.1186/s13148-019-0762-6. PMID: 31779681; PMCID: PMC6883525.

Palomeras S, Diaz-Lagares Á, Viñas G, Setien F, Ferreira HJ, Oliveras G, Crujeiras AB, Hernández A, Lum DH, Welm AL, Esteller M, Puig T. Epigenetic silencing of TGFBI confers resistance to trastuzumab in human breast cancer. Breast Cancer Res. 2019 Jul 5;21(1):79. doi: 10.1186/s13058-019-1160-x. PMID: 31277676; PMCID: PMC6612099.

Clavé S, Rodon N, Pijuan L, Díaz O, Lorenzo M, Rocha P, Taus Á, Blanco R, Bosch-Barrera J, Reguart N, de la Torre N, Oliveras G, Espinet B, Bellosillo B, Puig X, Arriola E, Salido M. Next-generation Sequencing for ALK and ROS1 Rearrangement Detection in Patients With Non-small-cell Lung Cancer: Implications of FISH-positive Patterns. Clin Lung Cancer. 2019 Jul;20(4):e421-e429. doi: 10.1016/j.cllc.2019.02.008. Epub 2019 Feb 26. PMID:30898567.

Bosch-Barrera J, Oliva E, Sais E, Vásquez CA, Roselló A, Menéndez JA. Hyperprogression after first dose of immunotherapy in a patient with radioresistant metastasis from nonsmall cell lung cancer. Anticancer Drugs. 2019 Nov;30(10):1067-1070. doi: 10.1097/CAD.0000000000000837. PMID: 31567311.

Cuyàs E, Fernández-Arroyo S, Buxó M, Pernas S, Dorca J, Álvarez I, Martínez S, Pérez-Garcia JM, Batista-López N, Rodríguez-Sánchez CA, Amillano K, Domínguez S, Luque M, Morilla I, Stradella A, Viñas G, Cortés J, Verdura S, Brunet J, López-Bonet E, Garcia M, Saidani S, Joven J, Martin-Castillo B, Menendez JA. Metformin induces a fasting- and antifolate-mimicking modification of systemic host metabolism in breast cancer patients. Aging (Albany NY). 2019 May 9;11(9):2874-2888. doi: 10.18632/aging.101960. PMID: 31076561; PMCID: PMC6535060.

Cuyàs E, Buxó M, Ferri Iglesias MJ, Verdura S, Pernas S, Dorca J, Álvarez I, Martínez S, Pérez-Garcia JM, Batista-López N, Rodríguez-Sánchez CA, Amillano K, Domínguez S, Luque M, Morilla I, Stradella A, Viñas G, Cortés J, Joven J, Brunet J, López-Bonet E, Garcia M, Saidani S, Queralt Moles X, Martin-Castillo B, Menendez JA. The C Allele of ATM rs11212617 Associates With Higher Pathological Complete Remission Rate in Breast Cancer Patients Treated With Neoadjuvant Metformin. Front Oncol. 2019 Mar 28;9:193. doi: 10.3389/fonc.2019.00193. PMID: 30984619; PMCID: PMC6447648.

Martin-Castillo B, Pernas S, Dorca J, Álvarez I, Martínez S, Pérez-Garcia JM, Batista-López N, Rodríguez-Sánchez CA, Amillano K, Domínguez S, Luque M, Stradella A, Morilla I, Viñas G, Cortés J, Cuyàs E, Verdura S, Fernández-Ochoa Á, Fernández-Arroyo S, Segura-Carretero A, Joven J, Pérez E, Bosch N, Garcia M, López-Bonet E, Saidani S, Buxó M, Menendez JA. A phase 2 trial of neoadjuvant metformin in combination with trastuzumab and chemotherapy in women with early HER2-positive breast cancer: the METTEN study. Oncotarget. 2018 Nov 2;9(86):356 87-35704. doi: 10.18632/oncotarget.26286. PMID: 30479698; PMCID: PMC6235018.

Àmbit:

Hospital

GTranslate

Formulario de búsqueda

Servei Assistencial

Personal Mèdic:

Personal Tècnic i Administratiu:

Àmbit: